Μέχρι τώρα είδαμε ότι κάθε κλάση στη Java αποτελεί ένα ξεχωριστό αρχείο. Για παράδειγμα η κλάση myFirstClass θα βρίσκεται στο αρχείο με το όνομα myFirstClass.java. Η εισαγωγή των πακέτων στην γλώσσα Java, εκτός από την ονοματοδοσία των αρχείων καθορίζει και τον κατάλογο (directory) μέσα στο οποίο θα πρέπει να βρίσκονται.

Ως παράδειγμα, θα θεωρήσουμε ξανά την κλάση Test του homework1 του μαθήματος CE325. Με βάση τα παραπάνω διαμορφώνεται το πακέτο με όνομα ce325.homework1 μέσα στο οποίο βρίσκεται η κλάση Test. Η ενδεικτική κλάση Test δίνεται παρακάτω

Test.java

package ce325.homework1;
public class Test {
  String test;  
  public Test(String s) { test = s; }
  public String toString() { return test; }
}

Ας θεωρήσουμε επίσης ότι όλα τα αρχεία της συγκεκριμένης εργασίας βρίσκονται μέσα στον κατάλογο project1/, σε ένα τυχαίο μονοπάτι του filesystem. Ιδανικά θα θέλαμε να διαχωρίσουμε τα αρχεία πηγαίου κώδικα .java από τα εκτελέσιμα αρχεια .class. Για τον λόγο αυτό δημιουργούμε δύο υποκαταλόγους

1. src για τον πηγαίο κώδικα και
2. build για τα μεταγλωττισμένα αρχεία.

Τελικά, έχουμε τους καταλόγους

project1/src
project1/build

Προκειμένου να μεταγλωττίσουμε την κλάση ce325.homework1.Test, αυτή θα πρέπει να βρίσκεται στον κατάλογο ce325/homework1/ μέσα στον φάκελο src, δηλαδή τελικά η κλάση Test.java θα βρίσκεται στον κατάλογο

project1/src/ce325/homework1/Test.java

Υποθέτοντας ότι μεταβαίνουμε μέσα στον κατάλογο project1, η παραπάνω κλάση μεταγλωττίζεται με μία δήλωση της μορφής

cd project1/
javac -d ./build/ src/ce325/homework1/Test.java